要将DNA翻译成蛋白必须执行下列步骤: 转录成RNA 获得标志链的密码子(三联子) 翻译成蛋白 大部分可以通过使用Biojava的Tools类的静态方法实现。下面的程序展示了这个过程。当然了,如果你的...
利用BioJava获得DNA,RNA或蛋白质的成分
在BioJava中,成分表(alphabets)是标记(symbol)的集合。(例如,DNA就是一种成分表,其中a,c,g,t是标记,DNA是这四种标记的集合。相似地,RNA由a,c,g,u四种标记组...
利用BioJava建立一个多义标记(ambiguous symbol)
IBU定义了标准的多义标记。例如Y代表C或T, R代表G或C, N代表任何一种碱基。Biojava用基本标记(BasisSymbol)来表示这些标记。基本标记对象可以包含一个或多个组份标记,而这些组份...