很多DNA分子,比如说质粒和细菌染色体是环状的。这样环状的分子上的位置就相对的模糊(比如说原点的定义不同,位置也不同)。在Biojava中真正的环状标志链并不存在。标志实际上是以数组或指针存储的。环状...
利用BioJava得到一条序列或标志链的互补链
使用DNATools.reverseComplement(SymbolList sl)方法能够很容易的获得序列或标志链的互补链。在RNATools中有相对应的方法用来获得RNA的互补链。 [code ...
利用BioJava从一个Fasta文件中读取序列
一个重要并且常用的I/O任务是将序列从文本文件读到内存中。SeqIOTools提供很多静态方法能够将文件读到Biojava中。 解决方案有很多。方案一更特别,方案二更通用。 方案一 [code lan...