454生命科学公司所研发的新一代测序平台基于光纤微流体技术和包裹了待测DNA片段的乳化液滴技术(炸药中的表面活性剂来维持乳液的热稳定性)。基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Se...
wapRNA:RNA与microRNA分析工具
wapRNA是一个RNA序列数据处理的网络平台,支持RNA和microRNA两种序列分析。它集成了多种分析工具,为处理下一代测序技术平台,如(Solexa,SOLiD)产出的RNA序列数据提供了便利。...
iAssembler: 拼接Roche-454/Sanger转录组数据的拼接软件
iAssembler利用MIRA以及CAP3软件,将454以及sanger测序产生的转录组数据(EST)拼接成基因组。 官方介绍: iAssembler is a standalone package...
CAT (Composition Analysis Toolkit) 组分分析工具
CAT是一个分析核酸中密码子使用偏性(codon usage bias)、密码子偏差系数(Codon Deviation Coefficient)等特征的分析工具。 CAT (Composition ...
Ka/Ks与进化选择压力
在遗传学中,Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换(Ka)和同意替换(Ks)之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变,反之则...
putty远程连接linux服务器中文乱码解决
方法一:推荐 打开putty主程序,选择window-〉Appearance-〉Font settings-〉Change…,选择Fixedsys字体,字符集选择CHINESE_GB2312。在win...
TranslatorX server:基于氨基酸序列的核酸比对工具
通常进行多序列比对的时候都是多条蛋白序列或者多条核酸序列进行比对。而TranslatorX是利用蛋白比对的结果对核酸序列进行比对的工具。 TranslatorX分为两个版本,其一是在线服务器,另外提供...
Fasta格式说明
序列的Fasta格式是最经常看到的格式之一。下面简介说明一下什么是FASTA格式。 Fasta格式开始于一个标识符:">",然后是一行描述,下面是一行行的序列。每一行最好不要超过80个字母。 如...
UB-IUPAC碱基代码表
代码 英文含义 中文含义 G Guanine 鸟嘌啉 A Adenine 腺嘌啉 T (U) Thymine (Uracil) 胸腺嘧啶 (尿嘧啶) C Cytosine 胞嘧啶 R (A or G)...
linux下恢复rm -f删除的文件
在linux下错误使用rm -rf 命令后并非完全无法补救,但是有个前提:在尝试恢复删除的数据前,删除文件的目录内不能存放新东西,不然覆盖多少就损失多少! 这里用到的套件是ext3grep、系统必须默...