基因编辑的能力像约翰内斯古腾堡(Johannes Gutenberg)印刷机一样具有革命性、时下可用性以及潜在的无限应用性。大多数DNA编辑工具处理速度慢、价格昂贵以及操作复杂,正像古腾堡发明一样,凝...
Nature年度技术:基因组编辑
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,上周出版的《Nature》杂志也对2011年进行了回顾:365 days: Nature's 10 ,评点了2011年的科技进展,科技政策以及重要人物。其中《Na...
基因组测序永无止境的根本原因
1869年瑞士青年学者米歇尔(Johann F. Miescher,1844—1895年)在莱茵河鳟鱼的精子里发现了脱氧核糖核酸分子,即现在大家熟知的DNA。他虽然也曾猜想过DNA可能与遗传有关,但还...
MEME:基于motif的序列分析工具
最近在做一个细菌的转录组的课题,其中一个任务是寻找CRP依赖的基因和operon的promoter序列。网上搜了一些资料。Virtual Footprint可以实现一些功能。但是Virtual Foo...
比较基因组学分析成为《PNAS》2011年热门文章
临近岁末,《美国国家科学院院刊》(PNAS)公布了今年的10大热点文章,其中包括生物学,医学,机械工程等多个方面。来自美国马里兰大学医学院的研究人员一篇题为“Bacillus anthracis co...
HHblits:让序列比对更快更准更灵敏
来自德国慕尼黑大学的研究人员发表了题为“HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignmen...
Perl中的代码注释
在写C,C++等程序的时候我们清楚利用 // 对单行代码进行注释,利用 /* */ 可以对多长代码进行。但是在写Perl脚本的时候,我们往往只知道利用 # 来注释单行代码(当然perl里面的第一行的...
乌骨鸡帮助我们了解家养动物的快速进化
人类一直都对家养动物的特征感兴趣,并学会了如何通过选育将这些特征继续下去。这导致了家养动物的基因快速进化。现在,人们可以研究这种进化过程,并用它来解释基本的进化学原理。今天,一项有关乌骨鸡的研究成果被...
序列的相似性
序列的相似性可以是定量的数值,也可以是定性的描述。相似度是一个数值,反映两条序列的相似程度。关于两条序列之间的关系,有许多名词,如相同、相似、同源、同功、直向同源、共生同源等。在进行序列比较时经常使用...
遗传信息载体—DNA
生物可以繁殖,能够复制出新的一代,通过繁殖后代使物种得以遗传和延续。生物的复制由基因所决定,复制是生命的基本特征,但不是生命的全部特征。计算机程序可以自动复制大量的拷贝,但是这些程序不是活动的生命,活...