生物学家发现一种细菌感染正在美国西南部最常见的一类农业害虫的种群中肆虐。这种细菌(立克次氏体)是人类斑疹伤寒始作俑者的近亲。它的宿主叫甜薯粉虱 (sweet potato whitefly),它们体型...
大米的逆袭:植物操纵了我们的身体吗?
科学家发现,植物中的一些微小RNA会进入人体,控制人体的基因活性,以更主动的方式影响人体。这是第一次实验证明,植物的微小RNA竟然是一个超级杀手,可以跨物种执行任务!这也许证明了“一方水土养一方人”,...
Sashimi-plot:isoform表达画图工具
以下是官方对Sashimi-plot的简单介绍: Sashimi-plot is a utility for automatically producing publication-quality p...
miRNEST:动植物中miRNA数据库
除了收集动植物miRNA及其功能的数据,已存的miRNA资源通常只收集有限数量物种的miRNAs。许多miRNAs,包括一些生物模型中的miRNA,都还没有被发现。因此,现在需要寻找新的microRN...
生命起源:寻找第一个自我复制者
众所周知,生命起源于一个能自我复制的简单分子。——现在,我们认为我们知道怎么做出一个来。 很久以前,宇宙中产生了一颗围绕中等恒星运行的新行星,在距今40亿年前,这颗行星的表面逐渐冷却。当时,那里还是一...
不确定性原理:进化如何两头下注
在变化的世界中,具有多样性是生存的关键。而进化似乎已经想到了一种不同寻常的方法产生更多的多样性。 一个人走进了一家酒吧。“我对进化有一种新的看法,”他宣布说,“你有什么东西可以让我把它写下来吗?”服务...
非自然的选择:人类是如何驱动进化的
人类活动不仅造成了大灭绝──我们还是存活物种进化的最大驱动力。 墨西哥的祖克(Zoque)人每年都会举行一种仪式,他们把一种有毒植物研碎、混合起来,倒进当地岩洞中的一条河里(如下图)。所有中毒而漂上水...
Bowtie使用介绍
Bowtie是一个超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等。...