除了收集动植物miRNA及其功能的数据,已存的miRNA资源通常只收集有限数量物种的miRNAs。许多miRNAs,包括一些生物模型中的miRNA,都还没有被发现。因此,现在需要寻找新的microRN...
生命起源:寻找第一个自我复制者
众所周知,生命起源于一个能自我复制的简单分子。——现在,我们认为我们知道怎么做出一个来。 很久以前,宇宙中产生了一颗围绕中等恒星运行的新行星,在距今40亿年前,这颗行星的表面逐渐冷却。当时,那里还是一...
不确定性原理:进化如何两头下注
在变化的世界中,具有多样性是生存的关键。而进化似乎已经想到了一种不同寻常的方法产生更多的多样性。 一个人走进了一家酒吧。“我对进化有一种新的看法,”他宣布说,“你有什么东西可以让我把它写下来吗?”服务...
非自然的选择:人类是如何驱动进化的
人类活动不仅造成了大灭绝──我们还是存活物种进化的最大驱动力。 墨西哥的祖克(Zoque)人每年都会举行一种仪式,他们把一种有毒植物研碎、混合起来,倒进当地岩洞中的一条河里(如下图)。所有中毒而漂上水...
Bowtie使用介绍
Bowtie是一个超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等。...
第二代测序数据处理工具软件汇总
Integrated solutions * CLCbio Genomics Workbench – de novo and reference assembly of Sanger, Roche F...
无root权限用户安装ABySS方法
首先引用一下官方对ABYSS的介绍: ABySS is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for ...
Velvet and Oases For Transcriptome Assembly(基于转录组进行拼接)
首先要有Linux环境的服务器或PC,推荐最低需求: 64bit Linux System (Rethat, CentOS, Fedora), 4 core CPU processors, 2.26G...
物理图谱
【相关概念】 DNA限制性内切酶酶切图谱又称DNA的物理图谱,它由一系列位置确定的多种限制性内切酶酶切位点组成,以直线或环状图式表示。在DNA序列分析、基因组的功能图谱绘制、DNA的无性繁殖、基因文库...
长链非编码RNA(lncRNA)简介
什么是长链非编码RNA? 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200nt的长链非编码RNA分子,它可在多层面上(表观遗传调控、...