随着测序技术的不断发展，宏基因组研究也越来越多。下面整一份从网上收集来的宏基因组研究的资料，与大家分享。为了满足一下不懂宏基因组同学的好奇，顺带从百度百科上取来一份词条作为介绍。 定义 宏基因组 ( ...

作者：牛登科  北京师范大学 教授 实验室网站（http://cmb.bnu.edu.cn/teachers/niudk.htm） 历史回顾 DNA是遗传物质，遗传物质决定了我们的生长、发育、疾病，甚...

第二代测序技术中Solexa以及它的升级版Hiseq，目前使用最多。为了帮助PLoB网友进一步了解Solexa相关的概念。与大家分享一篇网上看到的文章《Solexa测序技术中常见术语解释》，文章后面有...

显著性检验通常可以告诉我们一个观测值是否是有效的，例如检测两组样本均值差异的假设检验可以告诉我们这两组样本的均值是否相等（或者那个均值更大）。我们在实验中经常会因为各种问题（时间、经费、人力、物力）得...

Glimmer简介 Glimmer用于原核生物的基因预测，特别是细菌、古细菌、和病毒等的基因组。Glimmer（Gene Locator and Interpolated Markov ModelER...

生物信息在很大的一方面就是做数据的可视化。我们也经常想尽千方百计，想出好的点子来展示自己的数据，用一张生动、形象的的图片阐述其中的生物学故事。近期在网上看到一篇不错的文章，该文章罗列了一系列的数据可视...

最近中国科学院北京基因组研究所的《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》（GPB）杂志出了一期microRNA的专题刊。由Yu Jun和 Li Tongb...

不同基因座位的各等位基因在人群中以一定的频率出现。在某一群体中，不同座位某两个等位基因出现在同一条染色体上的频率高于预期的随机频率的现象，称连锁不平衡 (linkage disequilibrium)...

随着测序技术的蓬勃发展，转录组测序中Tophat的应用愈来愈频繁。但是很多论坛，博客等，都在针对Tophat中-r/--mate-inner-dist参数的解释不禁让我觉得有些不妥。 版本一： -r ...

前几天在生物之窗提了一个关于利用SamTools统计reads问题，链接地址：http://home.plob.org/question/63 结合PLOB上几位网友的建议和自己收集的资料，在这里与大...