DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表观。 DNA甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记，胚胎发育、肿瘤发生等方面发挥重要...

目标序列捕获测序，是将感兴趣的基因组区域定制成特异性探针与基因组DNA进行杂交（固相或液相），将目标基因组区域的DNA片段进行富集后再利用第二代测序技术进行测序。这种新的方法与PCR方法相比，通量高，...

染色质免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）是指对染色质免疫共沉淀（ChIP）获得的DNA片段进行大规模测序，并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。 Roche GS FLX Titaniu...

基因组是如何组装的？ 答：一般来说，针对以Illumina Gemone Analyzer测序结果为主的组装策略如下： （1）先利用短序列组装软件对paired-end数据进行de novo拼接，组装...

目前3种测序技术 Roche 454，Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。在基因组De Novo测序过程中，Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp，经常用于基...

比较基因组学是指在基因组图谱和序列分析的基础上，对已知基因和基因的结构进行比较，了解基因的功能，表达调控机制和物种进化过程的学科。一般包括以下几个方面的内容： （1） 和近缘物种进行成对基因组比对。可...

基因组注释包括以下方面的内容： （1） 重复序列的预测。通过比对已知的重复序列数据库，找出序列中包含的重复序列，识别类型并转化为N或者X，统计各种类型重复序列的分布。 （2） 编码基因的预测。通过将转...

利用新一代测序技术进行SNP分析，一般包括如下几步： （1） 测序结果的预处理，去除低质量的数据； （2） 利用短序列比对软件进行全基因组比对，找出多态性位点； （3） 根据一定规则来筛选可靠的SNP...

ChIP-seq分析过程中，随着测序深度加大，读长数目增多，分析得到的结合位点（‘峰’）的数目也随之增多，但会出现饱和，饱和以后，读长数目增加， ‘峰’的数目基本上不再改变。根据这个规律，为了确定测序...

一．荧光PCR原理 1．荧光共振能量传递 (FRET) 某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光，当另一屏蔽基团与其距离合适时，原发射光将会被屏蔽基团所吸收，并转化为其他波长的发射光或热能，称之...