染色质免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）是指对染色质免疫共沉淀（ChIP）获得的DNA片段进行大规模测序，并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。 Roche GS FLX Titaniu...

基因组是如何组装的？ 答：一般来说，针对以Illumina Gemone Analyzer测序结果为主的组装策略如下： （1）先利用短序列组装软件对paired-end数据进行de novo拼接，组装...

目前3种测序技术 Roche 454，Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。在基因组De Novo测序过程中，Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp，经常用于基...

比较基因组学是指在基因组图谱和序列分析的基础上，对已知基因和基因的结构进行比较，了解基因的功能，表达调控机制和物种进化过程的学科。一般包括以下几个方面的内容： （1） 和近缘物种进行成对基因组比对。可...

基因组注释包括以下方面的内容： （1） 重复序列的预测。通过比对已知的重复序列数据库，找出序列中包含的重复序列，识别类型并转化为N或者X，统计各种类型重复序列的分布。 （2） 编码基因的预测。通过将转...

利用新一代测序技术进行SNP分析，一般包括如下几步： （1） 测序结果的预处理，去除低质量的数据； （2） 利用短序列比对软件进行全基因组比对，找出多态性位点； （3） 根据一定规则来筛选可靠的SNP...

ChIP-seq分析过程中，随着测序深度加大，读长数目增多，分析得到的结合位点（‘峰’）的数目也随之增多，但会出现饱和，饱和以后，读长数目增加， ‘峰’的数目基本上不再改变。根据这个规律，为了确定测序...

一．荧光PCR原理 1．荧光共振能量传递 (FRET) 某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光，当另一屏蔽基团与其距离合适时，原发射光将会被屏蔽基团所吸收，并转化为其他波长的发射光或热能，称之...

原理： 真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecip...

从第一个重组克隆插入片段的一端分离出一个片段作为探针从文库中筛选第二个重组克隆，该克隆插入片段含有与探针重叠顺序和染色体的其他顺序。从第二个重组克隆的插入片段再分离出末端小片段筛选第三个重组克隆，如此...