通常一个研究项目能够获得的数据是有限的,以有限的样本特征来推断总体特征就称为统计推断。推断又可细分为区间估计和假设检验,二者虽有区别,但却是一枚硬币的两面,之间有着紧密的关联。 一、对总体均值进行区间...
R语言基础入门之三:常用统计函数运算
在R语言中经常会用到函数,例如上节中讲到的求样本统计量就需要均值函数(mean)和标准差函数(sd)。对于二元数值数据还用到协方差(cov),对于二元分类数据则可以用交叉联列表函数(table)。下文...
R语言基础入门之二:数据导入和描述统计
一、数据导入 对初学者来讲,面对一片空白的命令行窗口,第一道真正的难关也许就是数据的导入。数据导入有很多途径,例如从网页抓取、公共数据源获得、文本文件导入。为了快速入门,建议初学者采取R语言协同Exc...
R语言基础入门之一:引言
一、什么是R语言 R语言是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。由于R可以通过安装扩展包(Packages)而得到增...
R中正则表达式简介
R中的grep、grepl、sub、gsub、regexpr、gregexpr等函数都使用正则表达式的规则进行匹配。默认是egrep的规则,也可以选用Perl语言的规则。在这里,我们以R中的sub函数...
R中字符串处理和grep的用法
R通常被用来进行数值计算比较多,字符串处理相对较少,而且关于字符串的函数也不多,用得多的就是substr、strsplit、paste、regexpr这几个了。实际上R关于字符串处理的功能是非常强大的...
R的内存管理和垃圾清理
写R程序的人,相信都会遇到过“cannot allocate vector of size”或者“无法分配大小为…的矢量”这样的错误。原因很简单,基本都是产生一个大矩阵等对象时发生的,最干脆的解决办法...
ABI测序仪
过去20年,美国应用生物系统公司(ABI)在测序方面一直占据着垄断地位。自公司的共同创始人Leroy Hood在上世纪80年代中期设计了第一台自动荧光测序仪之后,生命科学研究就摆脱了手工测序的繁琐和辛...
ROCH-454 测序仪介绍
454公司可谓新一代测序技术的奠基人。2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里...
Illumina 测序仪介绍
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其专利核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化...