Illumina全基因组SNP芯片不仅可以call snp,还可以call CNV和LOH等结构性的变异。对于结构性变异的鉴定是通过BAF和logRratio来计算。CNV和LOH的区别在于CNV中l...
高度重复序列简介
高度重复序列在基因组中重复频率高,可达百万(106)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 (1)倒位(反...
生物芯片与第二代测序技术丁香园答疑帖精选(上)
生物芯片与第二代测序技术是两种重要的高通量基因组学研究方法,在生命科学研究领域有着极其广泛的应用前景。经过近20年的发展,生物芯片技术逐渐成熟,正在向着 “高密度,灵活定制,微量样品” 的方向发展,从...
生物芯片与第二代测序技术丁香园答疑帖精选(下)
生物芯片与第二代测序技术是两种重要的高通量基因组学研究方法,在生命科学研究领域有着极其广泛的应用前景。经过近20年的发展,生物芯片技术逐渐成熟,正在向着 “高密度,灵活定制,微量样品” 的方向发展,从...
利用转录组测序如何研究选择性剪接规律?
利用转录组测序如何研究选择性剪接规律? 答:在真核生物中,选择性剪接现象普遍存在。基因转录形成的mRNA前体(pre-mRNA)在剪接过程中因去掉不同的内含子区域或保留不同的外显子区域,可形成不同的剪...