生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员...
将DNA转化为艺术
生命科学专业的同学,大概都有过和核酸打交道的经历。但凡分子实验,大都既费心力又耗时间,核酸实验更是如此。 以 DNA 为例,即便研磨样品、合成引物、配制试剂等等前期工作准备得再充分,走完抽提 DNA、...
利用Ion半导体测序开展基因表达谱分析
新一代测序技术的出现改变了基因表达谱分析和转录组研究。在其他方法还依赖预知信息进行杂交探针或qPCR引物设计时,RNA-Seq技术可直接对测序文库中任一RNA分子进行无假设的分析。RNA-Seq技术不...
RNA-seq数据分析方法
最近读到一篇Nature Method上一篇关于RNA-seq数据分析的文章,觉得很不错,杜宇刚开始多转录组分析的同学很有帮助,里面还介绍了一些关于可变剪接的问题。 下面列上列上的基本信息: Comp...
可变剪接与蛋白质组多样性及其调节机制
武春晓 前言 可变剪接是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程。可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。剪接过程受多种顺式作...
SAM格式
SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 不同的软件,不同的时期,不同...
果蝇性染色体的进化过程追踪
果蝇常被用来进行遗传研究,因为其寿命比较短,而且在实验室可以很容易繁殖,其突变体可以被广泛使用。目前果蝇有1500中已知的种。近日一项刊登在Science上的研究追踪了果蝇一对性染色体的进化历程,这对...
某某能力为什么没有演化出来
来源:科学松鼠会 http://songshuhui.net/archives/66950 演化生物学是个好东西,因为它经常可以回答“为什么”的问题,而生物学其他领域往往只能回答到“怎样”这一步。不过...
音乐流变,循达尔文机制
来源:科学松鼠会 当代电子乐兴起之时,曾有一段时间,业界内部就合成与数字的优劣高下争执不休。有人迷恋techno因模糊性之不可捉摸而产生的流变迷幻,有人力挺digital由准确性之无法游移而带来的冰冷...
生物计算机里面养着啥生物?
一般来说,当我们不知道一个名词的意思时,会自动地把手伸向计算机键盘,打开搜索引擎浏览一番。但是对于生物计算机这个词条,总觉得搜索到的名词解释仍然令人一头雾水。机器和生命总是在科幻小说和电影中被设定为一...