作者:牛登科 三十年前问这个问题?你得到的答复是内含子没什么用,属于垃圾DNA或者说分子水平的寄生虫。 但是后来,一个又一个基因的可变剪接现象被发现。尤其是人类基因组测序完成后,人类基因组中没有发现原...
操纵子有什么用?
作者:牛登科 学过生物学的人可能都知道乳糖操纵子。在大肠杆菌基因组中,乳糖分解、运输的三个基因连在一起,由前端共同的Promoter区域调节三个基因的表达。这三个基因,就像俗话中一根绳上的蚂蚱。操纵子...
宏基因组学中微生物种群结构分析
什么叫宏基因组学?先做一个概念的普及,下面是摘取自百度百科的几段介绍: 宏基因组学又叫微生物环境基因组学、元基因组学,Metagenomics 宏基因组学通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构...
差异表达基因的分析(2)
应学生及个别博友的要求,尽管专业博文点击率和反应均很差,但在去San Diego参加PAG会议之前,还是抽时间给出【R高级教程】的第二专题。专题一给出了聚类分析的示例,本专题主要谈在表达谱芯片分析中如...
表达谱芯片的聚类分析
【在国际上,R软件的应用是数据分析的主流发展趋势之一,但我发现在国内R软件的使用远不如SPSS、SAS等软件那么流行。为推广R软件的使用,本博客将陆续推出“R高级教程”系列专辑,希望对生命科学领域的科...
最新研究质疑RNA测序数据的统计分析
过去几年间,高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果,其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是,这些调查结果现在受到了挑战,计算生物学家警告说,在这些数据密集型研究(data-int...
生物信息画图颜色搭配以及颜色卡
最近在用Qt写一个可视化软件,需要预先设定一些颜色搭配。刚好在网上收到了两张不错的颜色搭配图,与大家分享一下。大家在用R、matlab等画图的时候可以参考一下。 颜色搭配图: 各种颜色对应的名称与RB...
与细菌共生
撰文╱阿克曼(Jennifer Ackerman)翻譯╱涂可欣 重点提要 人体内的细菌细胞数是人类细胞的10倍,然而研究人员直到最近,才开始了解微生物对健康的帮助。 有些细菌会制造人体无法合成的有益化...
基因组装配新前沿:长片段完成完整的基因组
PacBio®长读序为基因组完成带来了新变革。资深基因组装配专家开发的错误校正软件使科学家能在其短读取数据中添加长读序数据,最终将那些未完成的基因组补全。 在过去的十年,基因组装配让一些科学家渴望转向...
比较介绍26种数据挖掘软件
1、数据挖掘软件之ANGOSS软件公司 KnowledgeSTUDIO 平台:NT , Windows 9X 功能:CHAID算法,支持PMML,留有与SAS、S-Plus的接口,能够灵活地导入外部模...