这估计是本世纪最重大的生物医学发现了。今天ENCODE疯狂的在nature等一次发了30篇文章。主题只有一个“垃圾DNA不是垃圾”。 ENCODE项目(ENCyclopedia Of DNA Elem...

准备再尝试一下，用大白话叙述一遍统计推断中最基础的东西（假设检验、P值、……），算是把这段时间的阅读和思考做个梳理（东西不难，思考侧重在如何表述和展示）。这次打算用一种“迂回的”表达方式，比如，本文从...

在上一篇文章里面简要介绍了p值的由来、计算和意义，这篇文章刚再次谈谈p-value。 P值就是当原假设为真时，比所得到的样本观察结果更极端的结果出现的概率。 The P-value is the pr...

在论坛，经常发现有人发关于P值的帖子，搜索了一下，一共有29个关于P值的帖子。的确，P值是最常用的一个统计学指标，几乎统计软件输出结果都有P值。了解P值的由来、计算和意义很有必要。 一、P值的由来 R...

高分辨率熔解（High-resolution melting，简称HRM）分析是一门新兴的技术。它仅仅通过PCR之后的熔解曲线分析，就能检测PCR片段的微小序列差异，从而应用在突变扫描、序列配对和基因...

在生物学特别是基因组学的研究工作中，经常会遇到多重假设检验（multiple testing）的问题；此时，得到的原始p值需要进行校正后才能使用，那么哪种校正方法更加适合自己的研究工作呢？p-valu...

懒人必看 Bowtie2 -q --phred33 --sensitive --end-to-end -I 0 -X 500 --fr --un unpaired --al aligned \ --u...

最近看到一篇很有意思的博文，关于统计学在心理学中应用引发的讨论。想到平时我们生物信息学分析数据的时候，往往很多结论和推断都是基于统计学意义上进行的，看到这篇博文觉得挺有意思，与生物信息人同飨。下面是博...

Clustal包括Clustalx和Clustalw（前者是图形化界面版本后者是命令界面），是生物信息学常用的多序列比对工具。最近在网上看到一篇关于clustal使用的介绍，里面对clustalx和c...

这次笔记的内容是多元线性回归的SPSS操作及解读。 在线性回归中，残差是一个非常重要的概念，它是估计值与观测值之差，表示因变量中除了分析的自变量外其他所有未进入模型的因素引起的变异，即不能由分析自变量...