1、RPKM 方法 根据 RNA-seq 原理,测序过程实际上是对转录组中各转录本打断后随机采样 的过程。因此,当某基因的表达水平较高时,该基因上的读段数就多;当某基因 的长度较长时,该基因上的读段数...
7.功能基因组相关信息分析(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第七章 7 功能基因组相关信息分析 功能基因组学是后基因组研究的核心内容,它强调发展和应用整体的(基因组水平或系统水平)实验方法分析基因组序列信息阐明基因功能,特点是采用高通量的实...
6.基因组序列信息分析(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第六章 6 基因组序列信息分析 DNA序列自身编码特征的分析是基因组信息学研究的基础,特别是随着大规模测序的日益增加,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。从测序仪的光密度采样与分析...
5.分子进化(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第五章 5 分子进化 分子进化钟的发现与中性理论的提出,极大地推动了进化尤其是分子进化研究,填补了人们对分子进化即微观进化认识上的空白,推动进化论的研究进入分子水平,并建立了一套依...
4.核酸与蛋白质结构和功能的预测分析(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第四章 4 核酸与蛋白质结构和功能的预测分析 人们获得各种核酸和蛋白质序列的目的是了解这个序列在生物体中充当了怎样的角色。例如,DNA序列中重复片段、编码区、启动子、内含子/外显子...