今天一个同学给我推荐一篇Nature Protocol 上文章,关于转录组差异表达分析。尚在正式通读之前习惯性浏览一遍图表,说实在这篇文章着实让我觉得有点“另类”。这是一篇活生生的利用Bowtie、t...
全基因表达分析标准方法存在重大缺陷
在当前许多各种不同的生物学研究中,用于产生和理解全局基因表达分析数据的常见假设能够导致关于基因活性和细胞行为方面严重缺陷性的结论。相关研究结果刊登在Cell期刊上。 怀海德研究所研究员Richard ...
单分子测序PacBio RS测序系统介绍
PacBio RS测序系统的feature 关于读长 如果把拼接工作看作是在做拼图游戏。NGS获得的读长都很短,就好象把一幅图打成非常小的碎片,然后做拼图。由于碎片太小,因此许多碎片看起来都差不多,这...
利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列
今天看到群里面有人讨论关于Perl和Bioperl的学习问题。所以在这里与大家分享几个关于蛋白质翻译的Bioperl代码,大家可以将下面的函数copy到自己的程序中,就可以将其作为函数调用。 代码一:...
“基因组科学与信息”培训研习班
随着基因组学与生物信息学关键技术的飞速发展,高通量测序技术已经广泛应用于生命科学的多个领域并实现了从“以大规模测序为目的”到“以大规模测序为手段来解决科学问题”的转型。许多专业的科研工作者们拥有非常丰...
微软也在做生物信息了
最近无意中在微软网站下的Microsoft Research上看到看到一项Microsoft Biology Initiative(简称MBI,ybzhao在PLoB这里暂且将其翻译成:“微软生物计划...
海峡两岸生命科学论坛(基因组与计算生物学)
由中国科学院、国家自然基金委支持,基因组所组织并承办的海峡两岸生命科学论坛-基因组与计算生物学 (Life Sciences Forum Between the Chinese Mainland an...
默默无闻的非编码RNA
中国科学院广州生物医药与健康研究院 科普小组 (原文:http://www.gibh.cas.cn/kxcb/kpwz/201107/t20110722_3312803.html 2013年2月23日...
第三代测序技术比较与总结
在第二代测序技术的协助下,个人基因组图谱正在如火如荼地绘制中。但第二代测序技术很快就遇上了强劲的对手——第三代测序技术,也被称为“下、下一代的测序(next-next-generation seque...
纵观转录组研究
如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA-seq分析工...