我们都知道，测序本身并不难，难就难在基因组的后续组装拼接，因为它涉及到大量需要考虑的问题，如重复、到位、覆盖率等等，于是如何有效的得到最后的序列或者有意义的Scaffold是做基因组面临的一个很大问题...

唐碧霞 王彦青 陈旭 庞博 赵文明 (中国科学院北京基因组研究所，北京，100029) 摘 要 高通量测序技术的发展使得测序数据量大规模的增长，从而为研究人员的数据分析工作带来了 挑战。基因组可视化工...

本文翻译自R in Action的附录B，如果对该书感兴趣，请自行购买或去图书馆阅读。 R导论的10.8也是讲定制环境的。 程序员最喜欢做的事之一是定制启动环境，好让程序按照他们喜欢方式工作。定制启动...

1. R包介绍 R的包（package）通常有两种: 二进制代码包（Binary package）：这种包属于即得即用型（ready-to-use），但是依赖与平台，比如Windows和Linux平台...

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在测序过程中，引物质量是影响测序结果的一个重要因素，由于载体测序通常使用的是载体上的通用引物，而且是由测序公司提供，因此一般不会出现问题。而 PCR产物测序使用的是个人自己设计并合成的引物，引物的质量...

碱基缺失其实是双模板的一种特殊形态，指某一样品在某一碱基后包含两类片段，其中一条片段比另一条片段少（或多）几bp或几十bp，因此在峰图上表现为从某处开始为两个峰的叠加，碱基缺失多发生在PCR测序中，并...

PolyA/T结构通常致其后的峰图出现重叠峰，PolyG/C 结构通常致其后的峰图出现信号衰减。Poly结构是导致测序失败最常见的原因之一，目前还没有非常有效的方法彻底解决Poly结构的影响，但一般而...

测序过程中最常见的问题是双峰，导致整个结果不可用，有时候我们也纳闷，明明挑的是单克隆，为什么还会碰到双峰呢？其实导致双峰的原因是多种的，双克隆只是其中的一原因，而且不同的起因在峰图上表现出不同的特征，...

启动Seqman，点击面板中的Add sequence　按钮添加将要拼接的序列 选中目标序列，点击Add--Done导入目标序列   如果导入的是峰图文件，可以双击文件名会弹出峰形图，通过移动黑色的分...