BEGINNERS HOWTO 英文原文 原作者 Brian Osborne briano at bioteam.net 版权 原作者保留版权,基于 Perl Artistic License协议可有...
推荐一款强大的进化树编辑软件
最近一个同学开发了一款很强大的进化树编辑、管理的在线服务程序,EvolView。EvolView是一个进化树可视化的软件,同时可以做各种编辑和处理,同时还支持额外增加一些数据上去,譬如把进化树和其他的...
三种小型测序仪的比较
小型测序仪一般只有台式电脑大小,价格便宜、操作简单,但通量相对较小,一般用于重测序和小基因组或基因组片段的de novo测序 Nicholas Loman在Nature Biotechnology发了...
基于NGS的miRNA测序以及接头序列介绍
一般成熟的miRNA长度在22nt左右,在过去miRNA主要是从已知的基因组序列中来预测,但是遗憾的是并不是所有的生物都有全基因组序列。现在随着新一代高通量测序技术的发展,即使没有全基因组序列我们也能...
Small RNA 测序分析与研究
small RNA是生物体内一类重要的功能分子,包括microRNA. siRNA和piRNA。它的主要功能是诱导基因沉默,调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。基于新一代高通量测序技术的s...
新基因组测序方法能够在单细胞水平上分析基因表达谱
生物学家和遗传学家长期以来想要在单个细胞水平上分析基因表达谱,但是技术限制一直使得它不能成为现实。 根据2012年7月22日在线发表在Nature Biotechnology期刊上的一项研究,研究人员...
将DNA转化为艺术
生命科学专业的同学,大概都有过和核酸打交道的经历。但凡分子实验,大都既费心力又耗时间,核酸实验更是如此。 以 DNA 为例,即便研磨样品、合成引物、配制试剂等等前期工作准备得再充分,走完抽提 DNA、...
利用Ion半导体测序开展基因表达谱分析
新一代测序技术的出现改变了基因表达谱分析和转录组研究。在其他方法还依赖预知信息进行杂交探针或qPCR引物设计时,RNA-Seq技术可直接对测序文库中任一RNA分子进行无假设的分析。RNA-Seq技术不...
RNA-seq数据分析方法
最近读到一篇Nature Method上一篇关于RNA-seq数据分析的文章,觉得很不错,杜宇刚开始多转录组分析的同学很有帮助,里面还介绍了一些关于可变剪接的问题。 下面列上列上的基本信息: Comp...
可变剪接与蛋白质组多样性及其调节机制
武春晓 前言 可变剪接是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程。可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。剪接过程受多种顺式作...