Glossary

SAM格式

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 不同的软件,不同的时期,不同...
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Advance

果蝇性染色体的进化过程追踪

果蝇常被用来进行遗传研究,因为其寿命比较短,而且在实验室可以很容易繁殖,其突变体可以被广泛使用。目前果蝇有1500中已知的种。近日一项刊登在Science上的研究追踪了果蝇一对性染色体的进化历程,这对...
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Popular Science

音乐流变,循达尔文机制

来源:科学松鼠会 当代电子乐兴起之时,曾有一段时间,业界内部就合成与数字的优劣高下争执不休。有人迷恋techno因模糊性之不可捉摸而产生的流变迷幻,有人力挺digital由准确性之无法游移而带来的冰冷...
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Popular Science

生物计算机里面养着啥生物?

一般来说,当我们不知道一个名词的意思时,会自动地把手伸向计算机键盘,打开搜索引擎浏览一番。但是对于生物计算机这个词条,总觉得搜索到的名词解释仍然令人一头雾水。机器和生命总是在科幻小说和电影中被设定为一...
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Glossary

内含子有什么用?

作者:牛登科 三十年前问这个问题?你得到的答复是内含子没什么用,属于垃圾DNA或者说分子水平的寄生虫。 但是后来,一个又一个基因的可变剪接现象被发现。尤其是人类基因组测序完成后,人类基因组中没有发现原...
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Glossary

操纵子有什么用?

作者:牛登科 学过生物学的人可能都知道乳糖操纵子。在大肠杆菌基因组中,乳糖分解、运输的三个基因连在一起,由前端共同的Promoter区域调节三个基因的表达。这三个基因,就像俗话中一根绳上的蚂蚱。操纵子...
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Transcriptomics

差异表达基因的分析(2)

应学生及个别博友的要求,尽管专业博文点击率和反应均很差,但在去San Diego参加PAG会议之前,还是抽时间给出【R高级教程】的第二专题。专题一给出了聚类分析的示例,本专题主要谈在表达谱芯片分析中如...
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Transcriptomics

表达谱芯片的聚类分析

【在国际上,R软件的应用是数据分析的主流发展趋势之一,但我发现在国内R软件的使用远不如SPSS、SAS等软件那么流行。为推广R软件的使用,本博客将陆续推出“R高级教程”系列专辑,希望对生命科学领域的科...
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