简介 Phil Green 和 Brent Ewing 开发的 phrap 软件包的一部分，用于比对两套 DNA 序列，如：可 以用来找出序列中的载体序列，并产生屏蔽了载体的序列；也可以用于 cDNA...
Phd2Fasta
简介 Phd2fasta 是 phred\phrap 软件包的一部分，phred\phrap 软件包由华盛顿大学分子生物技 术学院的 Phil Green 和 Brent Ewing 开发，主要用于学...
DNA测序峰图转化成Phred格式
简介 Phred是 phred\phrap 软件包的一部分，phred\phrap 软件包由华盛顿大学分子生物技术学院的 Phil Green 和 Brent Ewing 开发，主要用于学术科研活动。...
Linux、Unix常用命令（文件和目录相关）
mkdir mkdir dirname 建立子目录. 注意:用户不能在一个不存在的目录中建立子目录。 mkdir data 在当前目录下建立子目录 data mkdir /usr/data 在/usr...
SignalP：信号肽预测工具
SignalP是一个信号肽预测服务器，它的功能是预测给定的氨基酸序列中是否存在潜在的信号肽剪切位点及其所在，原核生物和真核生物都可以进行预测。目前服务器提供的是SignalP 4.0版本。在线服务器网...
转录组测序概述及实验分析流程
一、 转录组测序概述 转录组是特定物种、组织或细胞类型转录的所有RNA（转录本）的集合，包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA， 非编码RNA又包括：tRNA，rRNA，snoRNA...
第十三届全国植物基因组学大会-山东泰安
第十三届全国植物基因组大会第一轮通知 为充分展示植物基因组研究领域的重大进展，推动我国植物基因组学研究的深入和农业生物技术产业的快速发展，定于2012年8月19－22日（19日报到）在山东省泰安市召开...
psRobot :小分子RNA整合分析软件
植物小分子RNA，主要包括microRNA和小干扰RNA，在基因的转录和转录后调控过程中具有重要作用。第二代测序技术的逐渐成熟和广泛应用极大地推动了小分子RNA相关研究的发展，对不同组织和材料中的小分...
Howto make N50 better?
N50 statistic is widely used by bioinformaticians to judge the quality of their assemblies, but it i...
差异基因分析方法
在利用RNA-seq数据比较分析两个样品中同一个基因是否存在差异表达的时候，一般选取两个标准： i）FoldChange FoldChange，很容易理解了。就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。...