Appropriate choice of the ‘exp_cov’ (expected coverage) parameter in Velvet is very important to get...
用matlab画boxplot中的一些应用说明
由于matlab具有强大的计算功能,用其统计数据功能优点显而易见,这里分享使用matlab中的boxplot的一些技巧,供大家参考。 Matlab boxplot命令 格式如下 boxplot(X):...
PrimerX:设计定点突变引物的在线工具
PrimerX 是一款在线工具,用来设计突变PCR引物。PrimerX能够基于两种不同序列数据设计突变引物,一种可以输入突变的DNA序列,另一种是模板DNA编码的蛋白序列,另外还能够鉴定你设计的突变引...
dCAS:Desktop cDNA Annotation System
The Desktop cDNA Annotation System (dCAS) automates large-scale cDNA sequence analysis. dCAS allows ...
常用Motif预测软件
ELPH is a general-purpose Gibbs sampler for finding motifs in a set of DNA or protein sequences. The...
Tablet:Next Generation Sequence Assembly Visualization
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GFF格式说明
gff格式是Sanger研究所定义,是一种简单的、方便的对于DNA、RNA以及蛋白质序列的特征进行描述的一种数据格式,比如序列的那里到那里是基因,已经成为序列注释的通用格式,比如基因组的基因预测,许多...
MEGA构建系统进化树的步骤
MEGA 是一个非常优秀的序列比对和系统进化树构建软件,使用方便,完全免费,可从其网站下载, 最新版本是4.0。下面是用MEGA构建系统进化树的简明操作流程(具体细节请参考相关MEGA教程及使用说明)...
De Bruijn Graphs for Alternative Splicing and Repetitive Regions
Today we shall examine de Bruijn graphs for two structures that occur frequently in genomes or trans...
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