1 聚类分析介绍 1.1基本概念 聚类就是一种寻找数据之间一种内在结构的技术。聚类把全体数据实例组织成一些相似组,而这些相似组被称作聚类。处于相同聚类中的数据实例彼此相同,处于不同聚类中的实例彼此不同...
SPSS学习笔记之——重复测量的多因素方差分析
1、概述 重复测量数据的方差分析是对同一因变量进行重复测量的一种试验设计技术。在给予一种或多种处理后,分别在不同的时间点上通过重复测量同一个受试对象获得的指标的观察值,或者是通过重复测量同一个个体的不...
SPSS学习笔记之——协方差分析
1、分析原理 协方差分析是回归分析与方差分析的结合。在作两组和多组均数之间的比较前,用直线回归的方法找出各组因变量Y与协变量X之间的数量关系,求得在假定X相等时的修正均数,然后用方差分析比较修正均数之...
SPSS学习笔记之——多因素方差分析
问题: 对小白鼠喂以三种不同的营养素,目的是了解不同营养素增重的效果。采用随机区组设计方法,以窝别作为划分区组的特征,以消除遗传因素对体重增长的影响。现将同品系同体重的24只小白鼠分为8个区组,每个区...
SPSS学习笔记之——生存分析的Cox回归模型(比例风险模型)
一、生存分析基本概念 1、事件(Event) 指研究中规定的生存研究的终点,在研究开始之前就已经制定好。根据研究性质的不同,事件可以是患者的死亡、疾病的复发、仪器的故障,也可以是下岗工人的再就业等等。...
SPSS学习笔记之——Kaplan-Meier生存分析
一、概述 关于生存分析的相关概念,请参见https://www.plob.org/article/12219.html Kaplan-Meier用于估计生存函数,允许有一个分组变量进行生存率的组间比较...
使用Biopython翻译核酸为蛋白序列
在plob论坛学习到不少知识,其中看到很多关于bioperl的文章,但是没有见到人们用biopython的。 所以在此分享一个简单代码,用来翻译核酸为蛋白序列。 注:需要Biopython库支持。 以...
Cre-LoxP重组酶系统在转基因(基因打靶)动物实验中的原理及应用
Cre-LoxP重组酶系统在新型基因打靶中获得广泛应用,是条件性基因打靶、诱导性基因打靶、时空特异性基因打靶策略的技术核心。 Cre重组酶和LoxP序列 Cre重组酶:于1981年从P1噬菌体中发现,...
单细胞转录组分析:多样本合并与批次校正
前言 实际的科研项目中不可能只有一个样本,多样本的单细胞数据如何合并在一起,是否需要校正批次效应呢?先上一张图说明多样本scRNA数据的批次效应: 左边的图简单地把多个单细胞的数据合并在一起,不考虑去...
Linux中权限(r、w、x)对于目录与文件的意义
一、权限对于目录的意义 1、首先要明白的是目录主要的内容是记录文件名列表和子目录列表,而不是实际存放数据的地方。 2、r权限:拥有此权限表示可以读取目录结构列表,也就是说可以查看目录下的文件名和子目录...