昨天开始学用Cytoscape,其tutorial分为两个部分,基础的和高级 的。基础教程又分成了四课:Getting Started、Filters & Editor、Fetching Ex...
可复现的计算科学研究十条简单规则,以及自己的一些经验
《Ten Simple Rules for Reproducible Computational Research》对做计算科学方面研究的同仁有非常好的借鉴意义,本文结合我自己的经验对其阐述。 科学研...
千年基因转录组信息分析培训班
主办单位:千年基因 培训时间:2013.11.20-11.22 培训地点:广东•深圳 培训对象:从事生命科学、农学等领域的科研工作者、教师及学生 培训费用:3000元/人,含学费、资料费、上机费等。可...
全基因组项目学术研讨会
全基因组序列是揭示物种生命本质的基本依据和重要线索,将为功能基因挖掘、遗传育种、进化研究等奠定基础。随着高通量测序技术的快速发展,目前越来越多物种的基因组图谱已绘制完成,并已发表大量高影响力文章。然而...
使用Trimmonmatic进行NGS reads的过滤与修剪
1. Trimmomatic Trimmomatic使用JAVA运行,速度快。同时该软件进行reads QC的原理非常好。因此,最推荐使用此软件进行NGS reads的QC。 参考文献:Lohse M...
一文学会WGCNA分析
基本概念 WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。 适用于复杂的数据模式,推荐5组...
NGS数据的Error correction方法
现在进行error-correciton的算法有三种: k-spectrum-based、Suffix tree/array based 和 MSA based。本文对以下软件使用真实数据进行了评估:...
基因组Repeat Sequence的寻找
1. 重复序列简介和相关软件 参考自文献:Review:Identifying repeats and transposable elements in sequenced genomes: how ...
基因组学与生物信息学培训班息学培训班(含一天免费公开课)
华弈生物首期基因组学与生物信息学培训班 主办单位:北京华弈生物科技有限责任公司 培训地点:中国 北京 培训时间:2013年11月18日-22日 华弈生物联合市科委特邀中国基因组科学领域领军人物--于军...