近些年来,基因组学已经成为生命科学的重要组成部分,同时对整个生命科学的研究起到了巨大的推动作用。基因组学的规模化方法和海量信息导致科学理念和概念的更新。“发现导向”或“数据导向”的研究与“假说导向”的...
基因组组装基础策略
以Pacbio和Nanopore 为代表的三代测序技术,目前最成功的应用领域就是基因组组装,由于其长读长的特点,非常适合处理对于二代测序技术较难测通的高重复区域和高GC含量区域。因此对于基因组组装研究...
7 大类卷积神经网络(CNN)创新综述
深度卷积神经网络(CNN)是一种特殊类型的神经网络,在各种竞赛基准上表现出了当前最优结果。深度 CNN 架构在挑战性基准任务比赛中实现的高性能表明,创新的架构理念以及参数优化可以提高 CNN 在各种视...
Linux如何使用特殊权限:setuid、setgid 和 sticky 位
通常,在类 Unix 操作系统上,文件和目录的所有权是基于文件创建者的默认 uid(user-id)和 gid(group-id)的。启动一个进程时也是同样的情况:它以启动它的用户的 uid 和 gi...
2013年生物信息相关SCI杂志的影响因子
下面是2013年SCI杂志的影响因子,生物信息相关部分。提取出来供大家分享: 图片版部分,点击查看大图:
cufflinks的使用
一. 简介 Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等几支主要的程序。主要用于基因表达量的计算和差异表达基因的寻找。 二. 安装 C...
武汉大众源生生物信息学培训班
我们培训内容包括基础的计算机基础知识,同时包含生物信息分析的热点领域。 从计算机基础知识和信息分析两方面,带您一步一步走进生物信息。 上机实践一直伴随着整个课程,案例式的计算机基础知识学习方式,让您无...
表观基因组学实验的三个步骤
2008年早期,美国国家卫生研究院NIH宣布了一项涉及1.9亿元,时间长达5年的表观遗传学项目,这一项目作为NIH“路线图计划”(RoadMap Initiative)的组成部分,总体目标包括几个方面...
SAM格式-Bowtie2(简要介绍)
(首先推荐public Library of Bioinformatics的《SAM格式》和《Bowtie2使用方法与参数详细介绍》两篇文章,有不足处希望大家提出) 1,简介: 文件后缀名:.sam ...
SAM格式-Bismark(简要说明)
1,简介: 文件后缀名:.sam Bismark是一种基于Bowtie的分析BS-Seq(一种甲基化测序方法)数据的软件,包括read mapping和methylation calling。其中re...