下载软件 http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/ 我们这里就在window平台下使用,所以直接下载zip包即可,解压即可使用 准备数据 我这...
从RNA-seq结果到差异表达
翻译自:From RNA-seq reads to differential expression, Oshlack et al. Genome Biology 2010, 11:220 高通量测序技...
拷贝数变异检测芯片介绍
这里的拷贝数变异检测芯片指的是Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 cel数据,需要处理成segment及genotype数据 这个芯片在TCGA计划里...
基因组数据库-一个物种的官网
基因组数据库相当于一个物种的官网,关心该物种的科学家可以通过访问网站了解物种信息、科研进展、做blast等简单分析、下载基因组数据,基因组数据库最核心的模块是基因组浏览器,可以可视化查看基因结构、变异...
VCF格式
CHROM 染色体编号 POS 位置 ID 基因ID REF 参考基因组碱基 ALT 样本碱基 QUAL 变异可信度,越高越好 QUAL:Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该...
VCF格式解析
VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释...
ROC与AUC的定义与使用详解
分类模型评估: 指标 描述 Scikit-learn函数 Precision 精准度 from sklearn.metrics import precision_score Recall 召回率 fr...
基迪奥生物–招贤纳士
销售代表 招聘人数:10人 岗位职责 1、负责所在区域内高通量测序销售执行、策划及推广,并完成销售任务; 2、市场、客户信息收集、整理及反馈; 3、组织和配合公司进行市场推广、学术讲座等活动。 任职条...
GWAS和Genomic prediction概念、原理及应用
全基因组关联分析GWAS:Genome-Wide Association Study; 基本概念:利用分布于全基因组范围内的分子标记,基于它们与分析性状的连锁不平衡关系,通过各种统计分析方法,以获得与...
配对样本的差值不符合正态分布时不能进行配对t检验,那如何进行统计分析
⼀、问题与数据. 当⼀组配对样本的数据中差值d服从正态分布时,我们可以选⽤配对样本t检验的⽅法进⾏统计检验。但是,如果差值d不符合正态分布时,我们该如何处理呢? 我们知道有些数据并不符合参数检验的要求...