临床研究中，经常要计算某个样本的率(proportion)，以及根据样本的率估算总体率的95%可信区间(Confidence Interval，CI)。样本率的计算很容易，那如何计算估算总体率的95%...

简单的讲HMMER就是一款比对软件，可以类似于blast等，但是它提供的比对结果要精确于blast,相应的速度也要慢。与其类似的比对软件有PSI-blast、SAM、PFTOOLS等。 用途一：对于一...

在多细胞生物组织内，细胞往往通过介质将发送的信息传递给其他细胞。信息一旦发出，其他细胞会做出三种反应：响应、无响应和接收不到。这种模式非常类似于我们用电话跟其他人打电话时的场景，当我们拨打电话之后，对...

信号肽（signal peptides） SignalP是目前应用最广泛的氨基酸序列信号肽在线预测工具，预测给定的氨基酸序列中是否存在潜在的信号肽剪切位点及其所在未知。最新的版本是SignalP 5....

前言说明： Mothur命令教程从这个页面http://www.mothur.org/wiki/Category:Commands上查阅的所有命令，根据个人理解翻译了一下。大家使用的时候使用Ctrl+...

基迪奥生物第一届生物信息分析培训课 课程名称:RNA-seq分析以及绘图入门 授课背景: （1）不知道如何解读数据； （2）学习最基础的数据编辑和绘图，从而能自主筛选、整理分析结果； （3）对生物信息...

人工智能很大程度上是对未知输入的分类判别， 聚类是一种将数据点按一定规则分群的机器学习技术。 这里介绍5种常见的聚类方法： ▌K-均值聚类 k均值聚类是最著名的划分聚类算法，由于简洁和效率使得他成为所...

当我们进入大数据时代之后，并行运算就十分重要了。什么是大数据呢？引用一句流行语吧： Big data is hype. Everybody talks about big data; nobody k...

首先，在开始之前我觉得有必要稍微科普缓冲一下，以便不使得不熟悉生物信息或基因组的客官们疑惑。 1.基因组：每个人都有一个基因组，这里的“基因组”并不只是“基因”的集合，基因是控制性状的遗传单元（什么是...

Permutation test，也称置换检验，随机化检验或重随机化检验，是大牛Fisher首次提出的。由于Permutation test检验计算量大而限制了其应用和推广，以致不为人熟知。现在由于计...