如何利用SPSS制作联合诊断 ROC 曲线,详见ppt图文教程:
WES(3)snp-filter
其中freebayes,bcftools,gatk都是把所有的snp细节都call出来了,可以看到下面这些软件的结果有的高达一百多万个snp,而一般文献都说外显子组测序可鉴定约8万个变异! 这样得到突...
WES(2)snp-calling
准备文件:下载必备的软件和参考基因组数据 1、软件 ps:还有samtools,freebayes和varscan软件,我以前下载过,这次就没有再弄了,但是下面会用到 2、参考基因组 3、参考 突变数...
WES(1)测序质量控制
这一步主要看看这些外显子测序数据的测序质量如何: 首先用fastqc处理,会出一些图表,肯定是没问题的啦,如果数据有问题,公司就不会给你,那样不砸了他们自己的招牌嘛。 然后我们粗略统计下平均测序深度及...
总结卡方检验(Chi-square test)和费舍尔精确检验(Fisher exact test)的区别
之前我一直都没有弄清楚卡方检验和Fisher exact test的区别。今天花时间专门整理、学习一下。 卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法。它属于非参数检验的范畴,主要是比较两个及两个以...
江苏无锡易欧生物诚聘英才!
一、招聘岗位:英文编辑 工作地点: 无锡 岗位职责: 1)按SCI论文发表要求,对中文/英论文进行修改; 2)在规定时间内完成高质量的修改任务; 3)撰写英文科研报告。 任职要求: 1)生物、医学、农...
SPSS:交互作用指数及其计算
在研究数据的分析过程中,我们经常会遇到交互作用的问题,而且这是一个不太好解释和描述的问题。本文就跟大家一起来讨论一下Rothman K.J.等人提出的用来描述交互作用的指标及其计算。Rothman K...
黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院招聘一名生物信息学教师
黑龙江八一农垦大学: www.hlau.cn 招聘生物信息学教师 要求:博士 (优秀人员可放宽至硕士,工作突出者可选送到美国攻读博士) 如有意向可以联系王老师 邮箱:635021840@qq.com...
使用 PhyML 构建进化树
1. PhyML 简介 使用 PhyML 构建最大似然树。 参考文献:New Algorithms and Methods to Estimate Maximum-Likelihood Phyloge...
color space的测序数据
看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张,像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟,都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...