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看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张，像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟，都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...

  DNA甲基化分析流程示意图 Workflow of high-throughput DNA methylation analysis. The workflow shows the ba...

########################################################### ################### 一、下载安装circos及perl ##...

地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/ 里面主要有以下几个文件 我这里主要介绍gene2ensembl，gene2accession， gene2pubmed...

这是跟tophat和cufflinks套装紧密搭配使用的一个R包，能出大部分文章要求的标准化图片。 一：安装并加装该R包 安装就用source(“http://bioconductor.org/bio...

安装HTSeq，需要Python版本在2.5以上(但是在Python 3下不行)，并且需要安装NumPy。如果已经安装了NumPy的话，安装HTSeq并不困难。但是如果没有安装的话，可能会比较麻烦。 ...

一：下载安装该软件 下载htseq这个python模块安装解压包，依赖于很多python的其它安装包及库，模块，我最讨厌python了，在有些电脑上特别难安装，而且服务器还有权限的问题。 解压进入该目...

为什么要用这个软件？：因为转录组reads比对到基因组reads用bwa和bowtie的效果都不够好，所以我们选择tophat 它做了什么？：tophat把测序的转录组的原始reads比对到了参考基因...