例如,在我们对鉴定到的差异蛋白做GO功能注释后,通常会计算一个p值。当某个蛋白的p值小于0.05(5%)时,我们通常认为这个蛋白在两个样本中的表达是有差异的。但是仍旧有5%的概率,这个蛋白并不是差异蛋...
HGVS变异命名规则简介(PPT版本)
规范的命名是基因变异解读中不可或缺的一部分。ACMG变异分类标准建议对变异进行统一的标准化命名以确保定义明确并实现基因组信息的有效共享和下游使用。1998年由人类基因组变异协会(HGVS)、人类变异项...
GSEA使用事项小结
最近为了了解下GSEA的算法的整体思路以及软件一些主要参数的具体含义,从头看了下其R代码,由于其R代码是作者在软件早期写的,其功能并不是很完善,但是其核心的思路还是在代码中体现出来了(其实主要还是GS...
ChIP-Seq分析小实战(三)
ChIP-Seq分析小实战(一) ChIP-Seq分析小实战(二) ChIP-Seq分析小实战(三) 在ChIP-Seq分析小实战(一)中以将数据做好了准备,接着就是按照文章中所述将ChIP-seq数...
ChIP-Seq分析小实战(二)
ChIP-Seq分析小实战(一) ChIP-Seq分析小实战(二) ChIP-Seq分析小实战(三) 在ChIP-Seq分析小实战(一)中以将数据做好了准备,接着就是按照文章中所述将ChIP-seq数...
ChIP-Seq分析小实战(一)
ChIP-Seq分析小实战(一) ChIP-Seq分析小实战(二) ChIP-Seq分析小实战(三) ChIP知识点的梳理 ChIP属于表观遗传学中的一门技术,我第一次了解表观遗传学是通过一本叫遗传的...