1:分析流程图如下 2: 首先就是将样本的reads合并在一起命令如下： cat 1M_READS_sample/*.left.fq > reads.ALL.left.fq cat 1M_REA...

整个分析用TopHat进行比对，比对完成后将比对输出作为cufflinke拼接的输入（单独拼接），将单独拼接的结果使用cuffmerge混合，然后使用cuffdiff做差异，使用r软件包CummeRb...

使用Epicalc2000进行简单迅速随机分组。说到随机分组，我们介绍过不少简单易行的方法，比如基于随机数字表的方法进行手工分组，基于Excel的方法进行分组等等，当然我们也可以使用SAS、R、SPS...

一、残差方差齐性判断 1. 残差方差齐性 回顾一下前面介绍过的残差方差齐性，即残差ei的大小不随预测值水平的变化而变化。我们在进行残差分析时，可以通过绘制标准化残差和标准化预测值的散点图来进行判断。若...

预测模型构建与模型评价变量筛选模型评价正则化技术聚类分析主成分与因子分析无现有模型模型构建参数化模型半参数化模型非参数化模型一般线性模型广义线性模型线性回归Logistic回归泊松回归Cox比例风险模...

1. 背景介绍 人们对于“算命”这样的事情总是乐此不彼，无论是中国文化中“算命占卜”还是西方文化中的“占星术”，无不说明人们对于此道的热衷。本章讨论的构建预测模型也是一种“算命”，只是这是一种更为科学...

1. 背景知识 本章我们将用一个具体案例来介绍用R语言构建Logistic回归预测模型并绘制Nomogram的完整过程。有关预测模型的构建流程我们将在下一章《预测模型系列04–基于R的生存资料预测模型...

前一篇文章：《多因素回归分析模型中的变量筛选方法 》中介绍了三种变量筛选的方法，原文如下：“第一种情况，当有效样本量很大，统计学检验效能足够的时候，可以使用6种变量自动筛选的方法中的任何一种。.......

题记：本文成形于2015年并于2017年收录于由笔者与胡志德医生共同主编，中南大学出版社出版的《疯狂统计学》，此次属旧文重发，较原文有所改动。 1. 背景知识 多元线性回归、Logistic回归和Co...

本文主要介绍交叉验证(Cross-validation)的概念、基本思想、目的、常见的交叉验证形式、Holdout 验证、K-fold cross-validation和留一验证。时亦称循环估计，是一...