有这样两份标书,凝练之后,主要目标如下:(1)研究指标A,能否有效区分患者和健康对照;(2)研究工具A,能否有效预测并发症发生与否。 可以看到,申请者主要关注某个指标的诊断/预测价值,那怎么估算样本量...
用GEMINI来探索vcf格式的突变数据
第一次听说这个软件,是一个香港朋友推荐的:http://davetang.org/muse/2016/01/13/getting-started-with-gemini/ 他写的很棒,但是我当初以为是...
利用SPSS进行一致性检验并计算Kappa值
研究问题为:探讨两位警察对受试者行为判断的一致性,受试者行为的判定结果为“正常”或“可疑”。采用Cohen's kappa系数分析。 一、问题与数据 通过分析受试者进入超市后的行为,判断其是否存在盗窃...
伽马分布,指数分布,泊松分布的关系
1. 从意义上看: 指数分布解决的问题是“要等到一个随机事件发生,需要经历多久时间” 伽玛分布解决的问题是“要等到n个随机事件都发生,需要经历多久时间” 所以,伽玛分布可以看作是n个指数分布的独立随机...
让基因筛选变得更简单:群体进化选择消除分析
游戏“天天爱消除”曾经风靡一时,想必大家一定都玩过。其实在重测序分析中也有一个分析“爱消除”,那就是选择消除分析。群体进化选择消除分析:简单的说就是基因组某区域由于受到了选择而消除多态性。选择消除分析...
Postdoctoral Fellow, Master or PhD positions in Biostatistics, Statistic Genetics, Bioinformatics, Systems Biology and Genomics at Shanghai Jiao Tong University
Postdoctoral Fellow, Master or PhD position in Biostatistics, Statistic Genetics, Bioinformatics, Sy...
卡方检验到底干了什么
说到统计分析方法,卡方检验这个名字,也经常能想得起来,听得到。究其原因,一是因为常用,再有就是因为当年在学校上统计课的时候,这个方法一般是在t-检验之后就讲了,那一刻知识尚未“排山倒海”而来,就算多年...
诊断试验的各种一致性检验都搞清楚了吗?
诊断试验应用相当广泛:评价两种方法或仪器诊断结果是否一致,得用到诊断试验;看看两个大夫对同一群病人诊断是否一致,要用诊断试验;评价同一组患者前后两次诊断结果的一致性,还得用到诊断试验,等等. 简而言之...
重复测量方差分析和两因素方差分析
比如,前段时间,室友跟我聊起这么一个研究设计。20个人吃A药,20个人吃B药,分别在其听音乐和不听音乐时测定了疗效指标E(E为连续变量)。现在想搞明白1)听音乐和不听音乐对疗效有无差异;2)A药和B药...
样本量估算需要注意的问题
样本量估算需要考虑以下几点:第一,制定统计分析计划;第二,寻找重要参数值;第三,定义α和β;第四,确定组间的比例;第五,估算样本量,考虑失访等其他因素,适当增加样本量。具体如下: 周一到了,小明又...