Single Cell

单细胞测序综述

1、单细胞测序概论 过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材...
阅读全文
Statistics

临床研究中的混杂偏倚是什么?

临床研究中避免偏倚是保证质量需要考虑的问题,其中混杂偏倚是因为暴露因素对疾病的效应与混杂因素对疾病的效应混在一起,造成对暴露因素效应的估计偏倚,在临床研究过程中应引起重视,注意识别和控制。 例子: 研...
阅读全文
Statistics

如何进行单因素分析

提到单因素分析,我们并不陌生, t检验、方差分析、卡方检验等这些常用的分析方法都是单因素分析,你知道这些为什么叫单因素分析吗?单因素分析还有哪些?单因素分析是从单因素实验过来的,即在试验时处理(干预)...
阅读全文
Genomics

WES(3)snp-filter

其中freebayes,bcftools,gatk都是把所有的snp细节都call出来了,可以看到下面这些软件的结果有的高达一百多万个snp,而一般文献都说外显子组测序可鉴定约8万个变异! 这样得到突...
阅读全文
Genomics

WES(2)snp-calling

准备文件:下载必备的软件和参考基因组数据 1、软件 ps:还有samtools,freebayes和varscan软件,我以前下载过,这次就没有再弄了,但是下面会用到 2、参考基因组 3、参考 突变数...
阅读全文
Genomics

WES(1)测序质量控制

这一步主要看看这些外显子测序数据的测序质量如何: 首先用fastqc处理,会出一些图表,肯定是没问题的啦,如果数据有问题,公司就不会给你,那样不砸了他们自己的招牌嘛。 然后我们粗略统计下平均测序深度及...
阅读全文
Advertisement

江苏无锡易欧生物诚聘英才!

一、招聘岗位:英文编辑 工作地点: 无锡 岗位职责: 1)按SCI论文发表要求,对中文/英论文进行修改; 2)在规定时间内完成高质量的修改任务; 3)撰写英文科研报告。 任职要求: 1)生物、医学、农...
阅读全文