在研究数据的分析过程中,我们经常会遇到交互作用的问题,而且这是一个不太好解释和描述的问题。本文就跟大家一起来讨论一下Rothman K.J.等人提出的用来描述交互作用的指标及其计算。Rothman K...
黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院招聘一名生物信息学教师
黑龙江八一农垦大学: www.hlau.cn 招聘生物信息学教师 要求:博士 (优秀人员可放宽至硕士,工作突出者可选送到美国攻读博士) 如有意向可以联系王老师 邮箱:635021840@qq.com...
使用 PhyML 构建进化树
1. PhyML 简介 使用 PhyML 构建最大似然树。 参考文献:New Algorithms and Methods to Estimate Maximum-Likelihood Phyloge...
color space的测序数据
看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张,像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟,都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...
DNA甲基化分析流程和软件集锦
DNA甲基化分析流程示意图 Workflow of high-throughput DNA methylation analysis. The workflow shows the ba...
Circos在windows环境下运行的详细教程
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NCBI的基因entrez ID相关文件介绍
地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/ 里面主要有以下几个文件 我这里主要介绍gene2ensembl,gene2accession, gene2pubmed...
转录组cummeRbund操作笔记
这是跟tophat和cufflinks套装紧密搭配使用的一个R包,能出大部分文章要求的标准化图片。 一:安装并加装该R包 安装就用source(“http://bioconductor.org/bio...
在centOS 5上安装HTSeq
安装HTSeq,需要Python版本在2.5以上(但是在Python 3下不行),并且需要安装NumPy。如果已经安装了NumPy的话,安装HTSeq并不困难。但是如果没有安装的话,可能会比较麻烦。 ...
转录组HTseq对基因表达量进行计数
一:下载安装该软件 下载htseq这个python模块安装解压包,依赖于很多python的其它安装包及库,模块,我最讨厌python了,在有些电脑上特别难安装,而且服务器还有权限的问题。 解压进入该目...