为什么要用这个软件？：因为转录组reads比对到基因组reads用bwa和bowtie的效果都不够好，所以我们选择tophat 它做了什么？：tophat把测序的转录组的原始reads比对到了参考基因...
根据已知的参考基因组和GTF创建适合自己分析的基因组和GTF
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利用SPSS进行缺失值的多重插补
缺失值是我们临床研究中经常碰到的情况，如何处理缺失值至关重要。如何使用SPSS进行缺失值的多重插补，先看一下原始数据，原始数据出自张文彤教授的SPSS 统计分析高级教程，并对缺失数据进行改动。 首...
单细胞RNA-seq分析介绍
为什么要学习single-cell RNA-seq 在整个人体组织中，细胞类型、状态和相互作用是非常多种多样的，为了更好的了解这些组织和存在的细胞类型，我们需要更高分辨率的技术，而scRNA-seq提...
liftOver
功能：实现不同基因版本的转换。 下载地址：http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/ 使用方法：【从hg18转到hg19】 liftOver your.hg1...
SPSS:多组率多重比较的简单校正方法
SPSS:多组率多重比较的简单校正方法多个样本率之间的比较是我们在日常工作中经常遇到的，比如在A、B、C三组中分别有一个治愈率p1、p2和p3(仅将结果分为治愈和未治愈两类)。我们可以采用卡方检验比较...
DISCOVAR的使用
1. DISCOVAR简介 DISCOVAR 是有 ALLPATHS-LG 软件开发团队做出来的软件。主要用于利用 PE 250bp 数据与参考基因组的比对结果，对基因组进行 Variants cal...
关闭SSH终端程序继续运行
问题描述：当SSH远程连接到服务器上，然后运行一个服务 ./catalina.sh start，然后把终端开闭（切断SSH连接）之后，发现该服务中断，导致网页无法访问。 解决方法：使用nohup命令...
R语言:回归模型置信带的绘制
我们常常能够在书籍或者论文中看到有置信带的回归曲线，非常直观、漂亮。那这种图如何绘制呢?下面就简单介绍下使用R语言绘制置信带，因为R语言绘制置信带十分简单、便利。置信带的意义是：在满足线性回归的假设条...
陈连福第三期NGS生物信息学讲习与交流会议邀请函
陈连福第三期NGS生物信息学讲习与交流会议邀请函 会议简介 生物信息学入门艰难，精通更难。同时，生物信息学的重要性越来越紧迫，对其的需求量也越来越大，加上其技术性较深入，未来永远会缺乏精通生物信息学的...