在临床研究工作中,我们经常会使用到卡方检验,我们也在前期的文章中介绍了卡方检验的适用条件,以及何时应该使用Fisher’s exact test等问题。同时还应该注意合理地使用趋势卡方检验。但是很多研...
如何批量下载指定的序列?
【絮语】 下载序列简单不过,无非就是联网NCBI主页,选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载,而且下载的序列是指定的AC或GI的呢?实现这一目的通常办法是借助一些生物软件的检索功...
图解SAS软件统计分析(一):基本知识和界面操作
本文介绍常用统计分析软件SAS,大多数研究者一听到SAS要编程,就想着会很难,但当你熟悉SAS软件的基本操作界面之后,基本上通过拷贝复制就能得到你想要的结果。接下来详细介绍SAS的基本知识和界面操作。...
SPSS:Logistic回归的预测功能
Logistic回归经常出现在医学科研中。比如,我们用Logistic回归分析低出生体重儿的影响因素,考虑的影响因素有:产妇年龄、产妇孕前体重、产妇孕期是否吸烟、种族等。分析——回归——二元Logis...
SPSS实现连续变量与分类变量的转换
在进行数据分析时,常需要对原始数据进行适当的转换。也许需要将连续变量转换为分类变量(比如:将年龄转换为第2条>第3条,我们就可以知道29会被分到1组。 倘若,我们是这样的赋值规则:第1条:29到49;...
Meta分析概要
Meta分析已慢慢演变成了许多人发文章的捷径,也成了一些博士生毕业的救命稻草。我们总是觉得Meta分析看文献就行,又不用做实验,又不用收临床数据,还能发表一篇影响因子不错的文章。其实对于它的好坏,我们...
分类器性能指标之ROC曲线、AUC值
一 ROC曲线 1、ROC曲线:接收者操作特征(receiveroperating characteristic),roc曲线上每个点反映着对同一信号刺激的感受性。 横轴:负正类率(false pos...
基于pytorch实现transformer以及longformer以及代码详解
以下是一个基于PyTorch实现Transformer模型的简单示例代码,并对每个步骤进行了详细的注释。请注意,这个示例主要着重于模型的实现,不包括数据处理和训练部分。 import torch im...
ggplot2画图教程
ggplot2是什么? ggplot2是用于绘图的R语言扩展包,其理念根植于《Grammar of Graphics》一书。它将绘图视为一种映射,即从数学空间映射到图形元素空间。例如将不同的数值映射...
PacBio:你了解多少?
原文作者:陈巍学基因; 原文标题《PacBio单分子超长测序》部分图片PLoB有修改 测序原理: 1. 用4种荧光分别标记4种dNTP 2. 在测序芯片的底部做出许多用与入射光波长相应的小孔,特定的孔...