在分类任务中,人们总是喜欢基于错误率来衡量分类器任务的成功程度。错误率指的是在所有测试样例中错分的样例比例。实际上,这样的度量错误掩盖了样例如何被分错的事实。在机器学习中,有一个普遍适用的称为混淆矩阵...
SPSS缺失值标记
在我们临床科研数据进行分析时,常见到个案缺失的情况,缺失值得个案与不带缺失值得个案不同,且很多统计理论都依据完整的个案,缺失的个案会使所需要的理论复杂化。那么在统计分析中,如何对缺失值进行标记呢? 这...
如何用SignalP预测信号肽
SignalP是目前应用最广泛的氨基酸序列信号肽在线预测工具。最新的版本是SignalP 4.1,预测方法基于多种人工神经网络算法,可预测细菌和真核生物氨基酸序列中的信号肽切割位点。 SignalP ...
用phyML对多重比对phy文件来构建进化树
本来还没这么快写进化专题的,但是有个朋友要我帮忙跑一下她的phy文件,看看能否生成树,我就试用了一下phyml这个软件,挺简单的。 一、下载并安装该软件 这是一个很简单的软件,我们直接下载它的二进制程...
linux基础知识培训
Linux操作系统是生物信息技能的基础,大部分生物信息处理软件是基于linux操作系统,linux具有多任务、并行处理和批量处理的优势。要了解linux操作系统,请加入腾讯免费课程。
VCF格式详解
CHROM(chromosome):染色体 POS - position:参考基因组variant碱基位置,如果是INDEL(插入缺失),位置是INDEL的第一个碱基位置 ID - identifie...
SPSS教程:如何用图表构建器构建简单散点图和矩阵散点图?
想知道数据的分布情况却不知道用什么方法?用散点图吧,清晰地展现数据分布,有利于你判断选择接下来的分析方法哦。 今天小编将介绍如何用图表构建器构建简单散点图和矩阵散点图两种图表。 简单散点图 1.依次单...
第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会
您好! “第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会”将于2014年10月6日—9日在南京东南大学召开。 我们诚挚地邀请您参加这次全国学术大会,并向...
利用ggplot2画出各种漂亮图片详细教程
《使用ggplot2画图》 作者:Guangchuang Yu 原文链接:http://ygc.name/2014/05/11/use-ggplot2/ 1、Why use ggplot2 ggplo...
全面了解何时应该使用非参数检验?
俗话说得好,方差有三宝:独立、正态、齐性好。什么意思呢?就是说使用方差分析需要三个前提条件:1、各样本须是相互独立的随机样本;2、各样本来自正态分布总体;3、各总体方差相等,即方差齐。 纵然方差分析的...