昆明植物研究所章成君研究组(植物基因组学)招聘启事 中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库植物基因组学是2014年“引进海外杰出人才”章成君研究员带领的研究团队。该研究组的研究方向为...
Chip-seq处理流程
本文将以MACS为例,介绍ChIP-seq数据的处理流程。为节省篇幅,本文略去测序数据预处理、mapping reads等步骤,直接从peak-calling开始讲起。 一、首先粗略地介绍一下MACS...
生物信息分析过程中的常见文件的格式
刚接触生信分析的小白们这种尴尬的事情时有发生,为了帮助大家梳理这些剪不断理还乱的文件,本文以分析流程为主线,介绍各文件的格式以及有哪些常用命令来查看或处理它们。 1. 测序数据FASTQ文件 1)文件...
单细胞分析之fastMNN
fastMNN简介 MNN是Haghverdi等人提出的一种批次校正算法,由R语言的batchelor包实现。算法原理及性能评测的细节可参阅2018发表在Nature Biotechnology上的论...
质性研究的特点
质性研究的指导思想与定量研究的指导思想是不同的。质性研究的本质特点在于其研究方法和理论相对于其研究对象的合适性,重视和分析不同的视角以及把研究者对研究的反思作为认知活动的一个组成部分。 方法和理论对于...
10个机器学习中常用的距离度量方法
距离度量是有监督和无监督学习算法的基础,包括k近邻、支持向量机和k均值聚类等。 距离度量的选择影响我们的机器学习结果,因此考虑哪种度量最适合这个问题是很重要的。因此,我们在决定使用哪种测量方法时应该谨...
一千行MySQL学习笔记
/* 启动MySQL */ net start mysql /* 连接与断开服务器 */ mysql -h 地址 -P 端口 -u 用户名 -p 密码 /* 跳过权限验证登录MySQL ...
Meta分析的10个原则
近年来文献数量显著增加,大量不同主题的Meta分析数量也显著增长。在生物医学领域,Meta分析是多种发表类型中拥有较高被引数的类型。针对Meta分析已经有不少书籍或指南,本文是一篇指导Meta分析的简...
SPSS中实现正态性转换的小工具
当研究中的数据不符合正态分布时,我们常常会借助中位数、四分位数等指标描述数据,并采用非参数检验的方法进行统计分析。但个别时候,我们希望采用一些简单的回归模型进行探索,而多数我们熟悉的模型都对数据分布的...
什么是Meta回归
Meta分析很多人都听过,也有很多人做过,但是对于meta回归可能就有些懵了。 Meta回归,你只要知道它是一种统计方法,一种特殊的统计方法。它的因变量是meta分析的效应量,自变量为纳入meta分析...