有趣的是，大部分的short read比对工具都是由中国人写出来的。因此可以说华大基因（BGI， Beijing Genomics Institute, Chinese Academy of Scie...

什么是vcf?全称是variant call format，是用来记录SNP,INDEL和SV变异信息的文本。在GATK软件中得到最好的支持，当然SAMtools得到的结果也是VCF格式，和GATK的...

随着PLOB上的文章不断增加，为了方便大家使用PLOB，新上线“我的收藏夹”功能。大家可以在阅读具体文章的时候，在文章页面点击在线收藏链接即可以收藏文章，下次访问时直接从在线收藏夹中点击收藏的页面。 ...

在数据进行分析时，我们往往需要先看一下数据的基本信息，比如求和、平均数、标准差、标准误、中位数、四分位数、最小值、最大值、极差、偏度、峰度等。在R中这不是难事，有N多的程序包函数可以实现这些功能，有时...

利血平可以使小鼠的去甲肾上腺素等递质下降，现考察某种新药是否具有对抗利血平的降递质作用，将24只小鼠随机分为4组，并给与不同的处理后，测量闹钟去甲肾上腺素的含量（ng/g组织），结果如下： 试进行分析...

当资料不满足正态分布时，教科书里常常说可以通过变量变换将原始数据做某种函数的转换，常用的变量变换有对数变换、平方根变换、平方根反正弦变换、倒数变换等，这些变换有各自适用的数据，需要多次尝试来寻找合适的...

在医学统计学中，有三个关于比值的概念，分别为相对危险度（relative risk，RR，也称 risk ratio）、风险比（hazard ratio，HR）和优势比（odds ratio，OR）。...

RR值，（Risk Ratio）称为相对危险度，或者危险比，实质就是两个率的比，是两组真实发病率、患病率或死亡率的比值。而我们介绍过，OR值是两个比值的比。通常是病例组中暴露和非暴露的比例比上对照组里...

由于连接测序仪的服务器不知道哪里抽了风，无法直接的生成fastq格式的文件，好久都无解，经过一段时间仍无法解决，所以采用曲线救国的方法，看能不能利用三方软件将bcl转换成fastq文件 google以...

microRNA是癌症个性化医疗的希望，人们一直希望能够解析它们的确切作用机理，并将其应用于临床。然而事实证明，这是一项充满挑战性的工作。 MicroRNA是可以沉默基因表达的非编码单链短RNA分子。...