Genomics

VCF格式

CHROM 染色体编号 POS 位置 ID 基因ID REF 参考基因组碱基 ALT 样本碱基 QUAL 变异可信度,越高越好 QUAL:Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该...
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Genomics

VCF格式解析

VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释...
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基迪奥生物–招贤纳士

销售代表 招聘人数:10人 岗位职责 1、负责所在区域内高通量测序销售执行、策划及推广,并完成销售任务; 2、市场、客户信息收集、整理及反馈; 3、组织和配合公司进行市场推广、学术讲座等活动。 任职条...
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Bioinformatics

统计BAM文件中的reads数

当完成测序的比对工作之后,我们得到了bam/sam文件。那么,如何得到reads的统计数据呢? 这有很多途径: 1.读取日志文件。对于bowtie的日志,其中会包括如下的描述: 31991083 re...
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Evolution

进化树上Bootstrap和Identity区别

Bootstrap,即自展值,是用来检验你所计算的进化树分支可信度的。简单地讲就是把序列的位点都重排,重排后的序列再用相同的办法构树,如果原来树的分枝在重排后构的树中也出现了,就给这个分枝打上一分,如...
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