“就提取几个序列，不需要命令行” ================================================== 刚接触生物信息学的同学，或者（和我一样）只是使用生物信息相关知识...
R 绘图参数设置函数par()详解
转自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9f23a8da01019bjv.html par()函数是R里有关绘图的重要函数之一，以下是对par()函数说明内容的一些整理。 ...
中国科学院北京基因组研究所大数据团队招收客座研究生
北京基因组研究所生物大数据团队招收客座研究生 中国科学院北京基因组研究所的生物大数据研究团队长期从事生物组学数据挖掘工作，致力于通过大数据和生物技术的结合服务于血液病、干细胞、肿瘤等人类健康 领域。承...
甲基化数据分析
相关的分析软件： methylKit： https://code.google.com/p/methylkit/ BSMAP：https://code.google.com/p/bsmap/ MOAB...
总结：Bootstrap(自助法)，Bagging，Boosting(提升)
前言 最近在理清一些很必要的也很基础的东西，记录一下，结合网上和文献，自己也有些易化使之更轻松理解，如有错误，请不吝赐教，多谢！ Bootstrap(自助法) Bootstrap是一种抽样方法 核心思...
人类基因组各种版本对应关系
首先是NCBI对应UCSC，对应ENSEMBL数据库： GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52. GRCh37 (hg19): ENSEMBL release_59/61/...
参考基因组和基因注释文件
通常测序生成的reads要与参考基因组或参考转录组进行比对，或Pseudo-alignment。所以首先需要获取参考基因组和参考转录组信息。 Ensembl http://www.ensembl.or...
单细胞转录组数据无监督聚类
背景 scRNA-seq 数据的计算分析包括质控，比对，定量，标准化，聚类，轨迹分析以及差异表达基因的鉴定等，其中聚类是给予转录组数据定义细胞类型的一个核心步骤，也是 scRNA-seq 最广泛的应用...
SPSS:回归模型连续型自变量的处理方式
一个回归分析模型美不美，关键点之一是我们如何对待连续型自变量。这里面有一些技巧，是大家需要重视的。 连续型自变量，首先要要明确，与研究结局Y是否具有线性关系。关于线性关系，无论是线性回归、logist...
所有队列研究都能计算RR值么？
队列研究是我们常用的一类研究方案，在研究中暴露在前、结局在后，未发生某一结局(未患病)的研究对象因为是否存在暴露(某潜在危险因素)被自然分成两组，经过一段时间的随访观察结局(是否患病)出现的情况。由于...