在进行数据处理时，有时需要将某些分类变量进行分层分析，例如对品种感病性中的发病和不发病分别进行分析，此时就需要通过折分文件来实现，SPSS拆分文件（Split Files）。 我们先在数据编辑窗口打开...

笔者之前在学习TensorFlow，也在自己的笔记本上完成了安装，在PyCharm中进行学习。但是最近为了使用python的科学计算环境，我把之前的环境卸载了，并用Anaconda重新安装了Tenso...

Anacond的介绍 Anaconda指的是一个开源的Python发行版本，其包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项。 因为包含了大量的科学包，Anaconda 的下载文件比较大（...

生物信息分析常遇到R和R包使用和安装问题，最新版的R包特别难安装，而conda可以很好的解决这个问题。conda的安装相对简单此处不再赘述。 1. R安装 使用conda安装R时，最好先使用conda...

独立样本t检验试用于单因素被试者之间的差异检验。 三个应用条件： 独立性(independence)：各观察值之间相互独立,不能相互影响; 正态性(normality)：各个样本均来自正态总体; 方差...

文章 这是一篇2017发表在Genome Medicine上的文章A practical guide to single-cell RNA-sequencing for biomedical rese...

1. 背景介绍 关于绘制临床研究报告中亚组分析的森林图，我过去几乎试过了所有可能的工具，最早用绘制meta分析森林图的方法绘制临床研究亚组分析森林图，使用过Stata，RevMan，甚至用过Excel...

1. 背景知识 前面的文章我们已经探讨了评价一个预测模型区分度的统计学指标C-statistics（即ROC曲线下面积）。但C-statistics是否足够好呢？没有最好，只有更好。比如我通过某个连续...

题记：这一章讲综合判别改善指数(Integrated Discrimination Improvement, IDI)计算原理与方法。这个指标也用于判断预测模型改善情况，与NRI有类似也有不同，请各位...

1. 背景知识 净重新分类指数(NRI)这个指标最初用于评价诊断试验中新的诊断指标较旧诊断指标把研究对象进行正确分类在数量上的变化。既然可以评估诊断试验预测的准确度，那自然也可以用于判断预测模型的准确...