Bioinformatics

OR(Odd Ratio) – 比值比

R值的全称是odd ratio, OR值是相对危险度,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。 计算公式如下: Odd ratio, 95% CI 假定我们要鉴别一...
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Bioinformatics

怎么区分OR和RR?

一、先举个例子回顾下RR 之前,医咖会专门发了文章讲相对危险度(Relative Risk, RR)。队列研究中,研究者前瞻性地观察“暴露组”和“非暴露组”的发病情况,之后通过RR来评价暴露组研究对象...
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Bioinformatics

碱基平衡性与barcode选择

碱基平衡性 碱基复杂度与碱基多样性是一个意思;复杂度高,碱基即平衡。低多样性(low diversity)即碱基不平衡,指碱基的组成太单纯了,种类少。碱基复杂度本来无关紧要,从前除了设计PCR的时候考...
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Script

用awk进行简单的编程

# 用awk进行简单的编程 # 我们之前已经做过这个了,但是为了让大家我们了解我们正在做什么,我们来再做一遍。 # 提取埃博拉基因组的编码特征、基因以及编码序列。 efetch -db nucleot...
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Bioinformatics

WGCNA知识点详解

什么是WGCNA分析? WGCNA分析的全称是加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis),是用来描述不同样品之间基因关联模式的生物信息学分析方...
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