在研究中,经常需要分析疾病与各危险因素之间的定量关系,如食管癌的发生与吸烟、饮酒、不良饮食习惯等危险因素的关系,为了正确说明这种关系,需要排除一些混杂因素的影响。谈到如何很好的解决这个问题,就不得不提...
SPSS卡方检验p小于0.05之后的Bonferroni校正和Holm–Bonferroni校正
小明:我想比较三组之间的疗效有无差异 小编:卡方检验或者单因素logistic回归啊 小明:get it,结果显示p
线性混合模型在重复测量资料中的应用
重复测量资料在我们的临床研究中经常遇到,如果数据符合独立正态和方差齐,我们可以采用重复测量的方差分析去解决他。同样我们还可以采用混合线性模型去进行分析,本次咱们就讨论一下混合线性模型在重复测量方差分析...
用GEOquery从GEO数据库下载数据
Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库,设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据,但是后来也加入了甲基化芯片,甚至高通量测序数据! ...
Graphpad作图教程:一张图展示两个变量随时间变化趋势
如何使用graphpad绘制如下图形? 首先我们选择按照下图所示进行选择 然后,我们把模拟数据填上去: 这个时候点击左侧Graph对应的图,则出现右侧选择项,直接点击OK 后出来的图就...
HGNC数据库简介
人类基因命名委员会(HUGO Gene Nomenclature Committee);人类基因组命名委员会! 其实有了NCBI的entrez ID,然后还有refseq里面的ID,还有ensembl...
诊断试验的meta分析
在诊断试验中,通过金标准诊断为患者和非患者,采用某种试验方法诊断为阳性或阴性,列成四格表的形式,计算相关指标评价该试验方法的价值。单个诊断试验中,常用灵敏度、特异度、似然比、预测值等评价诊断试验的价值...
生物信息聚类分析方式汇总
1 定义 聚类分析(Cluster Analysis)是一类将数据所对应的研究对象进行分类的统计方法,它是将若干个个体集合,按照某种标准分成若干簇,并且希望簇内的样本尽可能地相似,而簇与簇之间要尽可能...
SPSS中的T检验
1.单样本T检验(One-Sample T Test) 单样本T检验主要用于样本均数和已知总体均数的比较,还可以计算相应的描述性统计量及样本均数和总体均数之差的95%可信区间。 如果Sig(P)>...
使用REST API批量下载ENCODE数据
本篇主要内容 本篇主要介绍两种方法,搜索并批量下载ENCODE数据。 方法一:在页面中搜索并获取下载地址 进入ENCODE portal主页:https://www.encodeproject.org...