在上一篇数据上传指南中,我们为大家介绍了GEO上传操作指南,今天小编就来介绍另一种重要的NCBI数据库SRA,它可用于存储测序的原始数据,实现资源共享。小编将SRA数据库的提交过程做一个简单概述,希望...
应用GraphPad Prism绘制箱式图详细过程
上图是 SCI 文献中的箱形图(Box-plot)。箱形图又称为盒须图、盒式图或箱线图,因形状如箱子而得名。箱形图是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。那么箱形图可以反应哪些数据分散信息呢?...
利用SPSS软件进行一致性检验
使用medcalc可以进行Kappa一致性评估!如何利用常用的SPSS软件进行一致性评估呢,详见下列图文教程!
如何利用SPSS软件进行数据转置?
用Excel导入的数据不符合SPSS分析需要,如变量在行,样本在列,利用SPSS转置功能就可以变成变量在列,样本在行,方便利用SPSS进行后续分析,详见下述ppt图文过程
什么样的结果是显著的:浅谈p值
p值是现在常用的统计学指标。当我们检验一个统计假设H0时,p值是当H0为真时样本结果或者更极端结果出现的概率。p值越小,也就越应该拒绝原假设,也就是结果越显著。在现在的生物医学研究中,一般的显著性标准...
置换检验(Permutation test),你可能不知道但一直在用!
Permutation test,也称置换检验,随机化检验或重随机化检验,是大牛Fisher首次提出的。由于Permutation test检验计算量大而限制了其应用和推广,以致不为人熟知。现在由于计...
对Protein序列进行InterPro注释
使用EBI的InterPro数据库,能对蛋白序列通过结构域方法进行基因家族分类注释。InterPro数据库整合了13个基因家族、结构域和功能位点的数据库,包括Pfam和CDD等。此外,InterPro...
生物信息常见文件的格式以及查看方式
生信分析过程中,会与很多不同格式的文件打交道,除了原始测序数据fastq之外,还需要准备基因组文件fasta格式和基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如bed、bed12、...
ggplot2 – 二维数据密度图
地理课上,我们经常会看到等高线。在ggplot2中,也有实现一个和等高线差不多的利器 stat_density2d() 看个例子先 # The base plot p <- ggplot(fai...
利用SPSS进行一般线性回归
在回归分析中,只有一个自变量的回归分析,称为一元回归;多于一个自变量的回归分析,称为多元回归。在做线性回归分析之前需要先做散点图,如果散点图不呈现线性关系,则不能做线性回归。 一、问题与数据 某地方病...