背景知识 Doublets及其形成的原因 单细胞测序期望每个barcode标签下只有一个真实的细胞,但是实际数据中会有两个或多个细胞共用一个barcode的情况,业内称之为doublets或multi...
Jupyter Notebook介绍、安装及使用教程
一、什么是Jupyter Notebook? 1. 简介 Jupyter Notebook是基于网页的用于交互计算的应用程序。其可被应用于全过程计算:开发、文档编写、运行代码和展示结果。 简而言之,J...
预测模型好不好,看看SPSS校正曲线就知道
临床研究中,我们常采用各种模型预测病人的结局(比如常见的logistic回归模型)。很重要的一点是,要保证预测模型是靠谱的。靠谱的模型才有意义,预测结果才有可能影响临床决策。怎么才算靠谱呢,预测结果和...
临床研究中的内对照和外对照各起什么作用
上次说到对照的作用就是帮咱们拨开云雾看到我们研究的因素的效应,减少自然病程等其他因素的影响。那对照怎么设呢?不同类型的对照起什么作用呢? 首先,对照内外有别。内对照是在一个已知的人群内部选择建立对照组...
从图看懂匹配过度——再谈匹配选择的问题
半年多前写过一篇文章,关于病例-对照研究中,到底是否需要匹配对照的问题。在那篇文章中,提到了一个概念——匹配过度(overmatching),并说明了匹配过度反而会影响结果。那么匹配过度到底是什么呢?...