在SPSS软件中,Data View(数据视图)在默认情况下每一行就是一条记录,通常情况下我们也是这样录入数据的。但是,在有些情况下我们得到的数据可能是已经初步汇总过的,如下面所说的情况,如果有168...
Kappa系数一致性检验和配对卡方检验SPSS图文详解
kappa系数一致性检验和配对卡方检验SPSS详细操作: 一、问题与数据 有两种方法可用于诊断某种癌症,A方法简单易行,成本低,患者更容易接受,B方法结果可靠,但操作繁琐,患者配合困难。某研究选择了5...
使用eggNOG数据库进行基因功能注释
1. EggNOG数据库简介 eggNOG ( Evolutionary Genealogy of Genes: Non-supervised Orthologous Groups) 公共数据库V5....
使用PHI-base数据库进行致病基因分析
1. PHI-base数据库简介 PHI-base数据库从文献中收集经过实验验证了的致病基因和效应基因的序列。目前(20190411)数据库版本为4.6版本,从3011篇文献中收集了263种致病菌(细...
利用Excel绘制双Y轴图详细过程图解
利用Excel绘制双Y轴图详细过程图解,如何绘制双坐标轴图?。首先,我们需要了解什么样的情况我们需要绘制双坐标轴图:当数据系列为2个或2个以上的时候,并且单位不同或者是数据量级差别较大时,就可以使...
R语言:列线图(Nomogram)的绘制及解读结果
手把手教你用R画列线图(Nomogram)及解读结果。 同样是构建多因素回归模型,往往我们另一个主要目的是为了对结局事件的发生风险进行预测,那么是否也可以将预测模型的结果,像森林图那样可视化地展示出来...
二分类logistic回归中纳入多少自变量合适?
在对临床数据的探索分析工作中,我们经常会使用多因素logistic回归分析去探索疾病的危险因素,也可以用它来做预测。但是每每在使用logistic回归分析的时候,我们都会纠结应该选哪些作为自变量呢?选...
诊断试验的Kappa值该怎么算
我们之前讲过可以使用符合率(agreement rate)评价不同医师的诊断结果和质量,从而衡量诊断试验的可重复性。符合率是评价诊断试验的重要指标,也是临床实践中的常用指标。但是,大家可能会注意到诊断...
WGCNA的总结
基本概念 WGCNA全名Weighted Gene Co-Expression Network Analysis,粗略翻译为加权基因共表达网络分析,因此可以归于共表达网络分析。 WGCNA主要运用于在...
SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Center for Biotechnology I...