箱形图（Box-plot），又称盒须图、盒式图或箱线图，因形状如箱子而得名，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图（如下图）。 它提供了一种只用 5 个点就对数据集做简单总结的方式，这 5 点为最...

比对可以选择BWA或者bowtie，测序数据可以是单端也可以是双端，我这里简单讲一个，但是脚本都列出来了。而且我选择的是bowtie比对，然后单端数据。 首先进入hg19的目录，对它进行两个索引 sa...

一，下载该软件 wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz ta...

物种的信息集合都在它的NCBI的taxid号里面，在NCBI里面关于它的英文介绍地址如下 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/taxonomy/ ，NCBI人为的给自然...

一．下载并安装这个软件 下载地址进下面，但是下载源码安装总是很困难，我直接下载bin文件可执行程序。 解压进入目录 首先make 然后make install即可 安装总是失败，我也不知道怎么回事，懒...

一：下载安装该软件 wget http://sourceforge.net/projects/rseqc/files/RSeQC-2.5.tar.gz/download tar zxvf RSeQC....

一：下载安装该R包 clusterProfiler是业界很出名的YGC写的R包，非常通俗易懂，也很好用，可以直接根据cuffdiff等找差异的软件找出的差异基因entrez ID号直接做好富集的所有内...

一，所谓的网站，其实就是一个网页版的可视化软件接口而已 看看网站主页，看看它需要什么数据 http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl 二，所需要...

一：下载安装该软件 下载安装该软件：  wget https://codeload.github.com/TransDecoder/TransDecoder/tar.gz/2.0.1 解压进入该目录，...

edgeR是一个研究重复计数数据差异表达的Bioconductor软件包。一个过度离散的泊松模型被用于说明生物学可变性和技术可变性。经验贝叶斯方法被用于减轻跨转录本的过度离散程度，改进了推断的可靠性。...