除了整合差异相对较小的scRNA-seq数据集外,liger也能用于整合数据差异较大、甚至研究的对象完全不同的多组学。本文将以scRNA-seq和scATAC-seq为例,展示liger多组学整合的相...
Liger单细胞多组学分析:seurat与liger
在使用liger整合单细胞RNA-seq的文章中,我提到liger的数据结构和函数调用不及seurat那么方便和个性化,因此将两者的优势结合起来能够大大便利我们的单细胞数据分析。本文主要介绍以下两种方...
Liger单细胞多组学分析:原理
因为最近的课题需要用到单细胞多组学整合分析的方法,因此我学习了一下liger这个单细胞下游分析R包,觉得它的数学原理和整合方法都挺优美的,尽管软件包中有一大堆bug和不便之处。我将写一个liger单细...