在我们涉足单细胞数据分析不久之后就会发现,我们在和一套新的理念打交道。在这套理念中,对象是常见的,数据是多维的,往往是一张核心表及其附属。我们对一张表是熟悉的,Excel极大地普及了这种熟悉,但是如何...
单细胞Seurat数据对象创建思维导图
在我们分析单细胞数据的时候,需要想象力的一点就是要理解数据结构。平时我们都是如何看数据结构的呢? library(Seurat) library(tidyverse) pbmc<-CreateS...
CellChat:细胞间相互作用分析利器
前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互作用,就有人推荐我们做一个...