1. 背景知识 上一节中我们讲解了R语言在Cox回归模型中计算C-index的方法,参见:预测模型系列 05 -- Cox回归中C-index的两种常用计算方法。本节我们将介绍用R语言计算Logist...
Cox回归中C-index的两种常用计算方法
1. 背景介绍 近十年来,临床研究中有一类预测模型构建与验证类的文章数量逐渐增多。简言之,预测模型是通过已知参数来预测临床未知的结局,而模型本身就是一个数学公式。也就是把已知的参数通过这个所谓的模型就...
卷积神经网络(CNN)中感受野的计算问题
感受野 在卷积神经网络中,感受野(Receptive Field)的定义是卷积神经网络每一层输出的特征图(feature map)上每个像素点在原始图像上映射的区域大小,这里的原始图像是指网络的输入图...
群体分化指数-Fst
简单介绍F-statistics 和 Fst 1. 概念 在群体遗传学中,F-statistics(Fixation indices)是衡量种群中基因型实际频率是否偏离遗传平衡(哈温平衡)理论比例的指...
群体固定系数Fst
Fst,用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为两个种群间是随机交配的,基因型完全相似;为1则表示是完全隔离的,完全不相似。它往往从基因的多样性来估计,比如SNP或者microsatellite...
群体遗传分化
1. 群体遗传分化的度量 (1)F-统计量 现实植物自然群体并非是理想群体,如果仅考虑单基因座上一对等位基因,对于由若干个地方群体组成的生物大群体,各层次现实群体中基因型频率期望值偏差一般用Fis、F...